土壤养分管理国家工程实验室(肥料)是以由中科院沈阳应用生态所为主，与南京土壤研究所联合中国科学院沈阳应用生态研究所等共同组建，于2011年8月经国家发改委批准设立。

绿色肥料工程实验室(实验室代码:GC201907-03)于2019年11月获批建立。该实验室是为加快实施创新驱动发展战略，提高我国工程化开发能力，推动突破企业技术瓶颈和产业转型级，促进地方经济发展而建设的，是中国科学院科技创新体系的重要组成部分。

辽宁省肥料工程中心成立于2006年，是由中科院沈阳应用生态研究所及沈阳中科新型肥料工程技术推广中心组建的工程心，主要任务是化肥添加剂、种微量元素肥料新品种、NPK深加工
技术、缓控释肥、有机肥与生物肥料、肥料加工新工艺、新设备。

稳定性肥料产业技术创新战略联盟由中国科学院沈阳应用生态研究所牵头，联合48家农科院所、高校及生产稳定性肥的企业组成，2013年被科技部认定为重点培育联盟。

全国缓控释肥料试验示范网由中国科学院沈阳应用生态研究所联合全国22个省农科院所共同组建。目前，已建立试验示范基地100多个，示范面积累计8200多亩，在全国26个省市自治区累计推广面积5000多万亩，为农民创造了良好的经济效益和社会效益。